Jinbe trata sobre Jinpei y su hijastra Miku. Ambos viven solos desde que Rikako, la madre de Miku, muriera hace algunos años. Mientras que Jinbe hace lo mejor posible en su rol de padre, siendo sobreprotector y celoso, Miku es una chica de instituto de 17 años que ya apunta a dejar el nido. La historia muestra la tierna relación entre ambos y como esperan enfrentarse al futuro sabiendo que no tienen relación de sangre entre ellos.