La protagonista, Kusanagi Yui, es una chica normal, que esta por graduarse y está empezando a preocuparse por su futuro. Ella es un poco más tradicional que la mayoría de las otras niñas debido a su crianza en un santuario. Ella es elegida como la humana para asistir a una escuela para los dioses que se han alejado de los humanos. Yui es ahora responsable de enseñar a los dioses sobre el ser humano y sobre los sentimientos de este. Para que los dioses no se nieguen a esto, Zeus los priva de sus poderes, y solo podrán recuperarlos al graduarse. El problema es que estos se van enamorando de a poco de Yui, y son posesivos hacia ella, lo que ocasiona un gran desacuerdo entre estos, y sus poderes podrían llegar a eclosionar, lastimando a los demás e incluso a ellos mismos, por lo cual ninguno sería capaz de volver a su mundo hasta entonces...