"Nanami Momozono es una chica de secundaria que, a pesar de ser menospreciada por sus compañeros de clase, tiene una personalidad fuerte y decidida. En su hogar, ella debe luchar por sobrevivir bajo las deudas de su padre, quien abandonó a la familia para huir de ellas.
Un día, mientras busca refugio de la lluvia, Nanami salva a un hombre que está siendo atacado por un perro. El hombre, Mikage, le ofrece su casa como agradecimiento. Lo que ella no sabía en ese momento es que la casa era en realidad un santuario, y Mikage era un dios.
Después de que Mikage se va, Nanami se da cuenta de que ha sido nombrada como la nueva diosa del santuario. Junto con Tomoe, su familiar zorro, Nanami comienza su nueva vida como una diosa y gestiona las responsabilidades del santuario mientras intenta equilibrar su vida escolar y sus relaciones interpersonales.
Nanami demuestra ser una líder capaz y una amiga confiable para aquellos que la conocen. Ella trabaja duro para ayudar a las personas en su comunidad y proteger a su familia de espíritus malvados que amenazan el santuario. Aunque sus inseguridades a menudo la hacen dudar de sí misma, Nanami es una joven valiente que siempre está dispuesta a luchar por lo que cree.
A medida que crece más cerca de los demás en el santuario, Nanami comienza a cuestionar sus sentimientos por Tomoe. Aunque su relación comienza como una estricta jerarquía de dios y familiar, la tensión romántica y las emociones comenzan a surgir. Nanami finalmente se da cuenta de que ha estado enamorada de Tomoe todo el tiempo.
A medida que Nanami continúa explorando su nueva vida como una diosa, ella sigue aprendiendo sobre el amor y la importancia de tener personas en las que puede confiar. Con su fuerte voluntad y su devoción por aquellos que ama, Nanami se convierte en una verdadera líder y diosa en Kamisama x Oresama x Ojousama."