Space Pirate se desarrolla en un futuro lejano, donde la humanidad encontró una nueva fuente de energía y pudo colonizar otros planetas, Jack es un joven de 24 años, el cual vive como cazarrecompenzas ilegal, actualmente está en busca de venganza contra el capitán Skarnova, el cual le cortó su brazo izquierdo, pero un desafortunado evento en su encuentro con este lo llevará a tener aventuras muy diferentes a las que se había imaginado.
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